286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1220 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  44.65 
 
 
222 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  34.01 
 
 
149 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  37.85 
 
 
193 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  33.52 
 
 
186 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.61 
 
 
193 aa  89  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 
234 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  28.81 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  29.35 
 
 
192 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.43 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.75 
 
 
188 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.05 
 
 
168 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.67 
 
 
170 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  31.69 
 
 
161 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.64 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  31.4 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  32.08 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.04 
 
 
183 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  24.05 
 
 
173 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  27.14 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.19 
 
 
173 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.09 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  25.6 
 
 
180 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
185 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 
173 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 
173 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
183 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.79 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30.16 
 
 
170 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 
173 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 
173 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  44.07 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  30.16 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 
173 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  29.23 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.25 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  28.67 
 
 
193 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  27.62 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  32.89 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  32.5 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  29.41 
 
 
164 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  30.58 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.31 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  30.43 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  44.23 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  31.67 
 
 
183 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  40.74 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  42.19 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.3 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  32.14 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
198 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  24.11 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  30.09 
 
 
188 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  32.48 
 
 
202 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  32.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
446 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
200 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  25.48 
 
 
211 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  22.96 
 
 
173 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.17 
 
 
183 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  23.65 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  28.74 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1040  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
169 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 
195 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.11 
 
 
191 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  27.38 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  28.18 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  27.13 
 
 
168 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  21.48 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  22.06 
 
 
191 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  33.05 
 
 
182 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.25 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
180 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  42.31 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  35.59 
 
 
180 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  32.17 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
182 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.89 
 
 
169 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  21.32 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5883  Redoxin domain protein  28.48 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  21.32 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  21.32 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  22.06 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>