157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0301 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.76 
 
 
234 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  51.81 
 
 
213 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.52 
 
 
193 aa  140  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  41.98 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  37.59 
 
 
149 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.85 
 
 
260 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  36.84 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  27.89 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  33.59 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  26.76 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.16 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.46 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
447 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.95 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.6 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30.53 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  30.2 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.75 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
169 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.08 
 
 
170 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.04 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  26.56 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.52 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.62 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  27.71 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.09 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  24.03 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.36 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  23.87 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  25.49 
 
 
182 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  22.22 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  22.22 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  25.38 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02122  periplasmic thioredoxin of cytochrome c-type biogenesis  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1464  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.38852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  28.57 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  22.29 
 
 
306 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.53 
 
 
280 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3332  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.3 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2333  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2494  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  24.31 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1455  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2343  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.439833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  21.79 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02081  hypothetical protein  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0746  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.285777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  22.09 
 
 
306 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  25.32 
 
 
178 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  21.82 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  21.93 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  21.93 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  21.93 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  21.93 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  21.93 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  30.48 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  21.71 
 
 
306 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  25.45 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  27.84 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  27.84 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  27.84 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  27.84 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.88 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3503  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.96 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  24.32 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  24.32 
 
 
504 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  24.05 
 
 
168 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2383  thiol:disulfide interChange protein DsbE  26.49 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  22.16 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  22.73 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  21.01 
 
 
191 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  23.57 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  24.14 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  26.8 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  25.25 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  22.16 
 
 
332 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  24.85 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>