60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1803 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  52.78 
 
 
193 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  47.95 
 
 
213 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.63 
 
 
193 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  38.18 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.16 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  36.05 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  30.82 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  30.09 
 
 
182 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  30.39 
 
 
170 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  31.37 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.6 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
169 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 
170 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
171 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.05 
 
 
447 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  27.36 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  26.74 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  28.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  26.04 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  25.77 
 
 
182 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  27.46 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
169 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  27.42 
 
 
178 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  25.77 
 
 
166 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  29.9 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.05 
 
 
433 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
174 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  25.35 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3002  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.09 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.67 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.4 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  24.2 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  21.01 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  22.93 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
173 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.28 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.12 
 
 
422 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  25.26 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.55 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.95 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2848  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  25.58 
 
 
437 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  23.91 
 
 
401 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  23.93 
 
 
165 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3613  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4041  thiol:disulfide interChange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4024  thiol:disulfide interChange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2474  thiol:disulfide interChange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4096  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447022  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2432  thiol:disulfide interchange protein DsbE  26.92 
 
 
185 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.74056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  26.55 
 
 
185 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.78 
 
 
184 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  24.46 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>