41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2549 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  47.86 
 
 
186 aa  133  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.71 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.86 
 
 
234 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  41.43 
 
 
213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  37.59 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.01 
 
 
260 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  39.37 
 
 
192 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  34.81 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  32.88 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.89 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  27.71 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  27.84 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.95 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  27.84 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  22.56 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  23.44 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2963  Redoxin domain protein  25.98 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.918448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  25.61 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
677 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.28 
 
 
169 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  22.92 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  21.82 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  27.93 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.28 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.36 
 
 
189 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  25.97 
 
 
190 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  26.32 
 
 
170 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  23.68 
 
 
174 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  22.89 
 
 
237 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 
196 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  26.5 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  25.44 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.43 
 
 
228 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  23.85 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.42 
 
 
447 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  26.53 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.19 
 
 
173 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  22.61 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.76 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>