35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1101 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  54.42 
 
 
298 aa  340  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  43.66 
 
 
293 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  44.28 
 
 
367 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  43.07 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  44.64 
 
 
297 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  42.75 
 
 
333 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.28 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  37.59 
 
 
290 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  38.85 
 
 
283 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  34.48 
 
 
293 aa  180  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  37.16 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  38.22 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  37.6 
 
 
304 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.49 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  35 
 
 
261 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  33.85 
 
 
251 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.34 
 
 
280 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  34.24 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  34.09 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.75 
 
 
264 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.36 
 
 
264 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.36 
 
 
264 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.36 
 
 
264 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.98 
 
 
264 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  31.16 
 
 
308 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  34.21 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  30.15 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  27.34 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.74 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  28.04 
 
 
414 aa  108  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  28.47 
 
 
317 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  29.23 
 
 
261 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  26.85 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  24.24 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>