24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2085 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  100 
 
 		 271 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  26.94 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  25.48 
 
 		 293 aa  72  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  23.02 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  24.24 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  23.6 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  24.23 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  25.45 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.89 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  24.23 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  21.16 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  21.16 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  23.77 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  21.16 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  21.16 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  21.16 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  23.87 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  23.39 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  22.36 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.36 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  22.87 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  22.8 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  22.42 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  18.22 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>