35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3103 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  100 
 
 		 367 aa  758    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  51.28 
 
 		 293 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  50.17 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  46.86 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  44.28 
 
 		 294 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  43.55 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  40.22 
 
 		 274 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  39.21 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  37.37 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  39.01 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.35 
 
 		 300 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  38.28 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  40.68 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.88 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  36.78 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.15 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.15 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.15 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.15 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.15 
 
 		 264 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  36.19 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  33.2 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  34.66 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.46 
 
 		 280 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  34.09 
 
 		 280 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  32.57 
 
 		 262 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.97 
 
 		 308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  28.35 
 
 		 260 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  32.86 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  28.08 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  26.37 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  27.18 
 
 		 281 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  25.77 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  28.02 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  23.6 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>