37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1010 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 		 308 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  61.76 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.77 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  31.16 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  33.22 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  27.97 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  31.37 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  29.09 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  29.31 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.01 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.62 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  30.31 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  27.68 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  26.28 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  28.38 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  27.7 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  27.5 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.64 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  26.07 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.21 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.21 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.21 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  25.89 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  29.72 
 
 		 414 aa  99.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.52 
 
 		 264 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  24.41 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  27.5 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  26.62 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  25.44 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  24.74 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  21.99 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  25.08 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  26.56 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  31.25 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.97 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  31.71 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  21.39 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>