34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2334 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  38.81 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.91 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  39.72 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  36.04 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  37.6 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  36.13 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  33.45 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  33.56 
 
 		 367 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  35.77 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  35.43 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  32.32 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  37.45 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.21 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  34.34 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  32.37 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  32.13 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  33.73 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.3 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  31.91 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  33.21 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  29.31 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  28.09 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.71 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.97 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.97 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.59 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.59 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  29.51 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  29.51 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  26.36 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  29.31 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.3 
 
 		 281 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  23.23 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>