34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  100 
 
 		 414 aa  834    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  32.62 
 
 		 261 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.69 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  34.41 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  35.27 
 
 		 262 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  30.71 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 		 264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.97 
 
 		 264 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.62 
 
 		 264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.97 
 
 		 264 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  32.37 
 
 		 293 aa  133  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.62 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  33.79 
 
 		 293 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  32.86 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  30.37 
 
 		 280 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.86 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.37 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  29.69 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  31.6 
 
 		 274 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  33.33 
 
 		 297 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  29.58 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  31.47 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  29.63 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  28.39 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  29.6 
 
 		 304 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  30.34 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  26.71 
 
 		 282 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  25.6 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  26.24 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.52 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  26.04 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  23.67 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  23.93 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  26.78 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>