35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1711 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  100 
 
 
259 aa  542  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.63 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.82 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.82 
 
 
264 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.82 
 
 
264 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  45.82 
 
 
264 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  38.76 
 
 
261 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  38.28 
 
 
367 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  39.23 
 
 
293 aa  176  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.7 
 
 
315 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.64 
 
 
280 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  36.26 
 
 
280 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  38.22 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  38.11 
 
 
300 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  35.41 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  32.8 
 
 
262 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  36.92 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  36.15 
 
 
293 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  32.98 
 
 
414 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  33.57 
 
 
274 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  33.72 
 
 
297 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  33.73 
 
 
304 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  33.21 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  31.88 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  34.09 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  32.2 
 
 
260 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  31.07 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  29.34 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.7 
 
 
308 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  29.13 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  24.57 
 
 
317 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  29.7 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  28.68 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  29.52 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  24.23 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>