34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  38 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  33.86 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  32.8 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  38.52 
 
 		 297 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  30.86 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.75 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.86 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  37.45 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.14 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.14 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.14 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  35.64 
 
 		 414 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.14 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  31.82 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  34.75 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.88 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  34.22 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  32.57 
 
 		 367 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.04 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  30.15 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  35.16 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  30 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.5 
 
 		 308 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  29.33 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  25.4 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  27.11 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  28.35 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  28.9 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  27.8 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  29.44 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  23.88 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  24.81 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  24.52 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>