34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0478 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  43.97 
 
 		 261 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  30.15 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  29.96 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.95 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  29.5 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  28.05 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  29.34 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  28.08 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  29.19 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  30.04 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.56 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.35 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.09 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  30.2 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  30.09 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  29.13 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  30.08 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  27.31 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  27.27 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  26.94 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  26.07 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  28.74 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  24.81 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  26.64 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  22.03 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  26.56 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  25.17 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.41 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>