34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1129 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  48.21 
 
 
290 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  50.97 
 
 
282 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  44.84 
 
 
283 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  38.28 
 
 
298 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  40.61 
 
 
293 aa  184  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  42.58 
 
 
297 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  36.19 
 
 
367 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  37.74 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  34.24 
 
 
294 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  31.23 
 
 
274 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.08 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  33.08 
 
 
304 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  32.2 
 
 
259 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  28.35 
 
 
293 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  30.68 
 
 
260 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  28.9 
 
 
251 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.7 
 
 
264 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.32 
 
 
264 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.32 
 
 
264 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.32 
 
 
264 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.32 
 
 
264 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  27.59 
 
 
261 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  25.36 
 
 
280 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.37 
 
 
280 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.38 
 
 
315 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  28.35 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  26.01 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  26.07 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  21.99 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  24.39 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  25.28 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  19.86 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  21.77 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>