34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1703 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  67.26 
 
 		 290 aa  361  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  60.65 
 
 		 283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  50.97 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  46.15 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  41.76 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  45.59 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  40.68 
 
 		 367 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  37.16 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  41.6 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  35.87 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  40.23 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  35.43 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.34 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  32.81 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  35.29 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.5 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.5 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.5 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.11 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  34.83 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.11 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  29.59 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  28.14 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  31.7 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.48 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.5 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  25.62 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  27.63 
 
 		 414 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  28.9 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  24.81 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  28.84 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  27.12 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  24.6 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>