38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1387 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 
261 aa  537  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.8 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.41 
 
 
264 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.41 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.02 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  41.41 
 
 
264 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  42.11 
 
 
315 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  43.55 
 
 
251 aa  199  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  38 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40 
 
 
280 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  39.39 
 
 
280 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  38.76 
 
 
259 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.23 
 
 
300 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  35 
 
 
294 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  33.2 
 
 
367 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  34.8 
 
 
274 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  36.64 
 
 
293 aa  155  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  34.6 
 
 
298 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  32.74 
 
 
414 aa  151  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  33.97 
 
 
293 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  32.32 
 
 
304 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  33.21 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  26.99 
 
 
317 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  29.39 
 
 
333 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.68 
 
 
308 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  27 
 
 
282 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  25.27 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  29.5 
 
 
291 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  29.64 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  25.53 
 
 
290 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  27.59 
 
 
260 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  26.15 
 
 
260 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  29.5 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.59 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  18.22 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  35.71 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  34.52 
 
 
379 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  47.37 
 
 
375 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>