32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1779 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  29.3 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  29.64 
 
 
261 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.25 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.5 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  27.31 
 
 
280 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  28.68 
 
 
259 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.31 
 
 
280 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  25.77 
 
 
367 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  25.4 
 
 
262 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  27.24 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.51 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.6 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.6 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.6 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.6 
 
 
264 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  24.91 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  28.16 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  23.21 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  25.19 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  22.09 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  24.61 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  24.8 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  22.93 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  24.75 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  23.55 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  23.67 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  21.77 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  28.68 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  21.39 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  20.63 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  22.98 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>