34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2181 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  100 
 
 
283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  60.21 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  60.65 
 
 
282 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  44.84 
 
 
260 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  40.07 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  39.21 
 
 
367 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  38.85 
 
 
294 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  40.79 
 
 
297 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  36.5 
 
 
298 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  35.84 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  35.97 
 
 
333 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.44 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  32.37 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  30.29 
 
 
293 aa  135  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  28.06 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.32 
 
 
315 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.01 
 
 
264 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.14 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.86 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.65 
 
 
264 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.65 
 
 
264 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.37 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  26.43 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  30.32 
 
 
260 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  31.07 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  25.27 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  24.41 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  24.29 
 
 
317 aa  92.8  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  27.11 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  30.1 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  27.27 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  24.13 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  21.94 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  23.67 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>