35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0160 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  33.07 
 
 		 293 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  33.73 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  29.66 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  32.48 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  28.35 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  30.32 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  30.68 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.84 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  26.54 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  27.34 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  31.52 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  29.34 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.66 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.94 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  26.64 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  28.24 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  26.15 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  27.24 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  23.74 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  26.36 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  24.23 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  24.74 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  23.85 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  24.52 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  26.12 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  26.64 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  23.21 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  24.75 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  24.23 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>