38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0558 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0558  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
315 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1242  anaerobic cobalt chelatase, cbiK  43.23 
 
 
280 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.193456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1436  sirohydrochlorin cobaltochelatase  43.98 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1387  anaerobic cobalt chelatase  42.11 
 
 
261 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1710  anaerobic cobalt chelatase  37.37 
 
 
293 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.719898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2656  cobalt chelatase  37.59 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2360  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.1 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.317527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2201  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.1 
 
 
264 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2147  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.1 
 
 
264 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2247  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.1 
 
 
264 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.169996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2194  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.1 
 
 
264 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2745  anaerobic cobalt chelatase  34.8 
 
 
298 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1711  anaerobic cobaltochelatase  39.7 
 
 
259 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0054  Sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.27 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3103  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like  32.88 
 
 
367 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1101  anaerobic cobalt chelatase  31.49 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2310  anaerobic cobalt chelatase  31.8 
 
 
297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2730  anaerobic cobalt chelatase  34.39 
 
 
274 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1496  anaerobic cobalt chelatase  32.97 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24480  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  31.39 
 
 
414 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0669  heme-binding protein FetB  31.37 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.168375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2334  anaerobic cobalt chelatase  32.97 
 
 
304 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1703  anaerobic cobalt chelatase  32.34 
 
 
282 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919547  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24820  cobalamin biosynthesis protein CbiK, Co2+ chelatase  30.04 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2181  heme-binding protein, putative  28.32 
 
 
283 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1010  anaerobic cobalt chelatase  27.62 
 
 
308 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0142  anaerobic cobalt chelatase  27.67 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1292  anaerobic cobalt chelatase  26.56 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0478  chelatase  28.95 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0160  anaerobic cobalt chelatase  28.94 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.478118  normal  0.129595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1129  anaerobic cobalt chelatase  25.38 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1779  anaerobic cobalt chelatase  27.5 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3653  anaerobic cobalt chelatase  27.54 
 
 
261 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0266  anaerobic cobalt chelatase  26.94 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2085  cobalamin biosynthesis protein CbiK Co2+ chelatase-like protein  25.89 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.02 
 
 
127 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  45.8  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  25.41 
 
 
127 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>