35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1095 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  97.67 
 
 		 1153 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1095  Pmt1  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  97.67 
 
 		 1153 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  86.05 
 
 		 1174 aa  155  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  86.05 
 
 		 1174 aa  155  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  62.07 
 
 		 1177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  62.07 
 
 		 1177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  60.92 
 
 		 1165 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  58.62 
 
 		 1165 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  58.62 
 
 		 1165 aa  105  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 1194 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  40.23 
 
 		 1008 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  41.38 
 
 		 1187 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  37.93 
 
 		 1182 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  39.08 
 
 		 1205 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  37.88 
 
 		 1302 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  38.1 
 
 		 1302 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  38.1 
 
 		 1302 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  38.1 
 
 		 1302 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  35.29 
 
 		 1194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1208 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  35.29 
 
 		 1206 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  39.29 
 
 		 1175 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  36.67 
 
 		 1157 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1206 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  35.38 
 
 		 1171 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1129 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  36.07 
 
 		 1130 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  34.92 
 
 		 1302 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  33.73 
 
 		 1218 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1176 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  34.92 
 
 		 1302 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1195 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  30.16 
 
 		 1268 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>