36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1564 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  26.59 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  27.8 
 
 		 873 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  24.48 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  26.71 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  26.61 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  27.14 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  27.13 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  25.52 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  27.13 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  27.13 
 
 		 439 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  26.89 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  26.89 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  25.58 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  25.36 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  24.61 
 
 		 432 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  24.7 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  24.24 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  23.89 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  39.81 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  24.06 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  22.6 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  22.71 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  24.9 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  21.71 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  24.18 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  24.66 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  20.88 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  26.9 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  20.92 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  25.16 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  34.25 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  22.82 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  21.91 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>