31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3759 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  809    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  65.58 
 
 
397 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  61.68 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  47.15 
 
 
401 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  35.54 
 
 
404 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  27.96 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  26.18 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  23.18 
 
 
440 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  25.3 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  23.6 
 
 
463 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  26.94 
 
 
439 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  25.91 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  22.08 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  26.53 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  26.53 
 
 
439 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  24.23 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  26.12 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  26.12 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  27.27 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  27.27 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  26.86 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  25.16 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  26.23 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  27.91 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  25.61 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  33.7 
 
 
483 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  23.31 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  24.53 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  21.25 
 
 
486 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>