34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1057 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  942    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  40.92 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  39.42 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  39.32 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  36.15 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  37.07 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  36.76 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  37.08 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  36.84 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  37.47 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  36.84 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  34.12 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  36.27 
 
 		 432 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  34.12 
 
 		 448 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  35.77 
 
 		 448 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  33.06 
 
 		 473 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  34.2 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  35.03 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  29.6 
 
 		 471 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  27.27 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  25.69 
 
 		 873 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  26.07 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  21.74 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  22.46 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  23.6 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  25.67 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  25.63 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  23.51 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  30.67 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  22.04 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  21.43 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  22.83 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  22.92 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>