36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1232 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  787    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  43.86 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  45.68 
 
 		 386 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  36 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  27.22 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  28.11 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  25.24 
 
 		 873 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  30.43 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  26.77 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  26.2 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  24.78 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  25.66 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  25.66 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  28.07 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  29.76 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  23.59 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  29.76 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  29.17 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  29.76 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  27.07 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  25.63 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  20.67 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  20.88 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  27.17 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  26.25 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  20.71 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  27.67 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  25.62 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  20.08 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  22.67 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  21 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  24.29 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  25.83 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>