27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2401 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  884    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  27.22 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  27.33 
 
 		 395 aa  93.2  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  28.21 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  27.33 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  24.06 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  25.97 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  23.6 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  27.33 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  24.81 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  32.14 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  23.1 
 
 		 873 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  23.01 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  24.94 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  22.61 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  23.62 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  24.09 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  24.69 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  23.5 
 
 		 448 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  24.92 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  22.8 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  23.51 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  23.55 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  23.25 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  23.55 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  23.16 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  24.48 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>