25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1595 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  836    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  37.28 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  36.25 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  37.32 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  34.8 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  25.89 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  26.67 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  26.1 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  20.67 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  22.16 
 
 		 873 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  23.26 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  22.58 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  21.63 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  28.21 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  29.51 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  23.01 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  25.57 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  21.91 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  24.37 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  25.47 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  22.64 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  24.44 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  23.42 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  24.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  23.62 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>