34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4468 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  63.22 
 
 
397 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  61.68 
 
 
394 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  47.63 
 
 
401 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  37.32 
 
 
404 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  27.59 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  23.59 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  23.99 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  27.16 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  23.5 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  24.15 
 
 
435 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  23.75 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  23.35 
 
 
471 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  25.32 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  22.04 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  36.14 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  24.44 
 
 
873 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  34.25 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  29.63 
 
 
439 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  29.63 
 
 
439 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  29.63 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  21.93 
 
 
440 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  30.45 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  23.12 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  26.38 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  22.4 
 
 
473 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  26.38 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  26.5 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  25.5 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  27.43 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  23.55 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  26.72 
 
 
432 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  23.28 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  21.79 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>