35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1224 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  100 
 
 
873 aa  1797    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0540  alpha amylase domain-containing protein  34.99 
 
 
355 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000140563  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  27.99 
 
 
417 aa  147  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3637  hypothetical protein  31.29 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000448903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0517  hypothetical protein  32.06 
 
 
366 aa  128  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0241651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  33.45 
 
 
387 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  27.8 
 
 
380 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  30.27 
 
 
444 aa  108  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  27.4 
 
 
432 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  28.97 
 
 
432 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  27.42 
 
 
439 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  28.77 
 
 
447 aa  92.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  28.87 
 
 
440 aa  90.9  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  27.96 
 
 
448 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  32.35 
 
 
483 aa  89  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  27.08 
 
 
432 aa  88.6  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  28.48 
 
 
448 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  25.69 
 
 
463 aa  88.2  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  28.48 
 
 
448 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  27.06 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  27.06 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  27.06 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  27.06 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  28.16 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  24.64 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  26.13 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  26.33 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  22.29 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  26.32 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  25 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  25.52 
 
 
363 aa  62.4  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  22.16 
 
 
404 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2401  hypothetical protein  22.49 
 
 
436 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16241  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  22.82 
 
 
414 aa  51.2  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  24.44 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>