31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1872 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  829    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  50.62 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  47.63 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  47.15 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  37.28 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  26.58 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  25.95 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  29.02 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  27.43 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  27.46 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  28.51 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  23.17 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  22.46 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  27.8 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  24.06 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  26.56 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  25.48 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  28.12 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  22.52 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  24.44 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  22.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  24.88 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  24.68 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  21 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  24.55 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1222  hypothetical protein  27.08 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.923895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  22.82 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  28.77 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>