34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0575 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  888    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.614613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2788  hypothetical protein  57.47 
 
 		 444 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1126  hypothetical protein  54.73 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0557834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1883  hypothetical protein  55.01 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0134121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2401  hypothetical protein  54.08 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00314941  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1925  hypothetical protein  54.08 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.051045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1918  hypothetical protein  54.08 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000283561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1892  hypothetical protein  54.08 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000381629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2102  hypothetical protein  53.61 
 
 		 447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1825  hypothetical protein  55.29 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000297573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2152  hypothetical protein  55.29 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000767873  normal  0.361147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2085  hypothetical protein  53.85 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00496552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3817  hypothetical protein  52.06 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.335226  hitchhiker  0.000533932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2221  hypothetical protein  46.8 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0500323  hitchhiker  0.0019612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1897  hypothetical protein  48.78 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1682  hypothetical protein  46.88 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147454  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2332  hypothetical protein  45.48 
 
 		 435 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0325377  normal  0.19178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1057  hypothetical protein  39.32 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1179  hypothetical protein  34.35 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1610  hypothetical protein  28.94 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1564  hypothetical protein  25.96 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1224  hypothetical protein  28.97 
 
 		 873 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5696  hypothetical protein  26.57 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1570  hypothetical protein  26.91 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.280205  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5763  hypothetical protein  29.66 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1872  hypothetical protein  26.58 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3759  hypothetical protein  27.96 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4468  hypothetical protein  27.59 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1595  hypothetical protein  26.1 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0545  hypothetical protein  34.71 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1816  hypothetical protein  26.34 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.25346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2410  hypothetical protein  33.04 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3553  hypothetical protein  24.19 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1232  hypothetical protein  25.83 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>