More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1937 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1937  molecular chaperone  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0143753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  40.7 
 
 
473 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  38.66 
 
 
380 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  41.03 
 
 
698 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  43 
 
 
355 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  36.46 
 
 
858 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  38.12 
 
 
643 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  40.59 
 
 
816 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  35.29 
 
 
597 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  39.6 
 
 
658 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  37.31 
 
 
657 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  35.78 
 
 
665 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  35.23 
 
 
632 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  28.22 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  27.32 
 
 
556 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  27.32 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  27.32 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  27.32 
 
 
556 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  27.32 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  27.32 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  27.32 
 
 
556 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  27.32 
 
 
556 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  28.08 
 
 
649 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  32.81 
 
 
880 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  26.83 
 
 
559 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  26.83 
 
 
559 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  26.83 
 
 
559 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  26.83 
 
 
559 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0563  hypothetical protein  68.89 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  28 
 
 
572 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0832  heat shock protein 70  30.39 
 
 
633 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.901264  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_7001  predicted protein  29.2 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.187202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  27.62 
 
 
563 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  28.36 
 
 
612 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  28.29 
 
 
563 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  30.73 
 
 
631 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0100  chaperone protein DnaK  29.13 
 
 
619 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.843776  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  29.35 
 
 
616 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  30.69 
 
 
572 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  24.88 
 
 
640 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
616 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  25.36 
 
 
614 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  25.63 
 
 
607 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1615  chaperone protein DnaK  25.47 
 
 
633 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.393444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  30.21 
 
 
632 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1059  2-alkenal reductase  32.05 
 
 
580 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00230509  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  26.87 
 
 
605 aa  55.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1403  Heat shock protein 70  31.71 
 
 
538 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0093  2-alkenal reductase  26.87 
 
 
573 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00453751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  30 
 
 
861 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0721  chaperone protein HscA  26.82 
 
 
617 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3673  heat shock protein 70  29.95 
 
 
556 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192305  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  29.35 
 
 
527 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
619 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  26.34 
 
 
596 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  26.34 
 
 
596 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  26.32 
 
 
651 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1501  Heat shock protein 70  29.86 
 
 
529 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  30.67 
 
 
625 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  25.13 
 
 
600 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3239  Heat shock protein 70  27.8 
 
 
1158 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573429  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
619 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  26.37 
 
 
602 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0631  chaperone protein HscA  30.67 
 
 
625 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  27.86 
 
 
608 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf781  molecular chaperone DnaK  25.49 
 
 
598 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  27.5 
 
 
563 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  28.36 
 
 
612 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0480  heat shock protein 70  27.71 
 
 
634 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.742328  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  26.83 
 
 
615 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  27.27 
 
 
627 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4187  molecular chaperone DnaK  30.99 
 
 
691 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.793765  normal  0.583998 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  27.35 
 
 
628 aa  53.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2233  chaperone protein DnaK  25.33 
 
 
629 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.1601  hitchhiker  0.0019124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6998  2-alkenal reductase  30.35 
 
 
546 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0983  molecular chaperone DnaK  26.24 
 
 
730 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1012  molecular chaperone DnaK  26.24 
 
 
730 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  26.07 
 
 
564 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  28.08 
 
 
577 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  31.58 
 
 
636 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0597  chaperone protein HscA  30.22 
 
 
626 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  25.87 
 
 
621 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  25.85 
 
 
600 aa  52  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  26.94 
 
 
622 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2631  molecular chaperone DnaK  31.34 
 
 
627 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0494047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  25.24 
 
 
644 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1606  chaperone protein DnaK  26.89 
 
 
629 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465496  normal  0.395903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  25.37 
 
 
596 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2846  molecular chaperone DnaK  26.79 
 
 
636 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.769317  normal  0.885007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0424  Heat shock protein 70  33.33 
 
 
524 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.205897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2588  heat shock protein 70  26.92 
 
 
536 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  27.11 
 
 
617 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  24.37 
 
 
610 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  28.71 
 
 
569 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1601  molecular chaperone DnaK  25.79 
 
 
729 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000716898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1395  Heat shock protein 70  28.22 
 
 
538 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  27.36 
 
 
614 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  30.14 
 
 
572 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  28.29 
 
 
617 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
637 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>