287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2656 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  246  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.496157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3149  protein of unknown function DUF59  63.06 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.894372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0663  hypothetical protein  52.71 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2837  hypothetical protein  57.14 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00762998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  44 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  42.45 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  41.05 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  38.61 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  46.39 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43.56 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  34.91 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  38.16 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  36.26 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  39.58 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  38.14 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  38.14 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.46 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  48.05 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  44.3 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  40.66 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  34.69 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  37.78 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  38.94 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  35.05 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  32.65 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  40.26 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  35.05 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  35.19 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  33.02 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  35.19 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  32.11 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  34.02 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4173  protein of unknown function DUF59  36.36 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  34.31 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  34.26 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  37.25 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  30.25 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.38 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  33.65 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  40.26 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  31.96 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  37.38 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  35.92 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  36.17 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  34.38 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  33.01 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  38.46 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  30.93 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  35.11 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  38.24 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  36.08 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  35.06 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  35.35 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  34.02 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  31.53 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  33.67 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  35.05 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  32.98 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  36.94 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  28.28 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  35 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2866  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.36 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  30.85 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  34.95 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  30.39 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  32.99 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.62 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  34.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  33.04 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  31.82 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>