More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2265 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2265  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
197 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.852133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  92.12 
 
 
305 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  59.17 
 
 
304 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  49.7 
 
 
308 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.26 
 
 
343 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  45.35 
 
 
314 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
312 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.13 
 
 
310 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.86 
 
 
332 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
313 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  42.51 
 
 
317 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.27 
 
 
333 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  44.12 
 
 
314 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
331 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  37.5 
 
 
317 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
307 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.59 
 
 
334 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
320 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.5 
 
 
317 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
325 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
339 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  38.6 
 
 
308 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.5 
 
 
317 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
317 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
308 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.51 
 
 
332 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.98 
 
 
332 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
307 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
323 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.77 
 
 
332 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
332 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 
333 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.25 
 
 
332 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.27 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.77 
 
 
332 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.08 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.35 
 
 
326 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.2 
 
 
308 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.21 
 
 
332 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
332 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
313 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
334 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
337 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.25 
 
 
332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.94 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  38.38 
 
 
339 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 
326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
333 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.42 
 
 
334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
333 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
334 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.72 
 
 
333 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.35 
 
 
639 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.5 
 
 
310 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.59 
 
 
338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.2 
 
 
333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.38 
 
 
333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  42.57 
 
 
313 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
348 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
326 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  45.12 
 
 
308 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.01 
 
 
323 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
333 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
333 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.22 
 
 
334 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.62 
 
 
322 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.77 
 
 
333 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.9 
 
 
314 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
333 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.17 
 
 
339 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
339 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.57 
 
 
308 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.46 
 
 
314 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.57 
 
 
328 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
333 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
333 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.78 
 
 
322 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10098  zinc-binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01290)  35.09 
 
 
332 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5828  normal  0.819485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
333 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
307 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.32 
 
 
314 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.87 
 
 
311 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
327 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
322 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
328 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47141  predicted protein  40 
 
 
396 aa  101  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.303382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.66 
 
 
329 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
323 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
327 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.09 
 
 
338 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.22 
 
 
287 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
333 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
327 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.57 
 
 
327 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.53 
 
 
313 aa  99  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.11 
 
 
318 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>