More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2261 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  81.24 
 
 
485 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
485 aa  963    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  81.86 
 
 
474 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.72 
 
 
484 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.98 
 
 
465 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.8 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.31 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.72 
 
 
479 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 
496 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  45.06 
 
 
492 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.29 
 
 
480 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.2 
 
 
485 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.2 
 
 
485 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.03 
 
 
485 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.76 
 
 
493 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.47 
 
 
476 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  46.17 
 
 
477 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.05 
 
 
493 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.75 
 
 
476 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.76 
 
 
490 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.69 
 
 
491 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.38 
 
 
220 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.5 
 
 
213 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.97 
 
 
213 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.22 
 
 
225 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.36 
 
 
206 aa  213  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.59 
 
 
213 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.67 
 
 
260 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.17 
 
 
209 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.6 
 
 
217 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.44 
 
 
224 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.03 
 
 
211 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.27 
 
 
207 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  54.66 
 
 
218 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.89 
 
 
224 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.56 
 
 
428 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  54.66 
 
 
218 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  54.66 
 
 
218 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.57 
 
 
202 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.88 
 
 
219 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.03 
 
 
237 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.92 
 
 
224 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
217 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
217 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.6 
 
 
223 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.99 
 
 
223 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.99 
 
 
223 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  30.75 
 
 
507 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  50 
 
 
235 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.5 
 
 
546 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.7 
 
 
244 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.64 
 
 
300 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.49 
 
 
214 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.75 
 
 
217 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  36.88 
 
 
265 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.42 
 
 
247 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  39.35 
 
 
299 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  35.25 
 
 
264 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.66 
 
 
207 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.22 
 
 
230 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.22 
 
 
230 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.8 
 
 
229 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.86 
 
 
208 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.41 
 
 
229 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  49.43 
 
 
211 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.83 
 
 
217 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.82 
 
 
223 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.77 
 
 
216 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.85 
 
 
279 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  37.55 
 
 
295 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  34.74 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
206 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.31 
 
 
216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  37.5 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  35.89 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.26 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.68 
 
 
205 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.7 
 
 
222 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.17 
 
 
201 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.46 
 
 
245 aa  123  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.2 
 
 
210 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.34 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.62 
 
 
243 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.45 
 
 
205 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.54 
 
 
264 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  34.82 
 
 
282 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.14 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.14 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.6 
 
 
207 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.24 
 
 
187 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.63 
 
 
191 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.8 
 
 
309 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.24 
 
 
276 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.11 
 
 
315 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  34 
 
 
285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.17 
 
 
285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.78 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.2 
 
 
277 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.2 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>