65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4595 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 		 476 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.57 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  45.27 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.7 
 
 		 495 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.06 
 
 		 493 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.52 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.82 
 
 		 485 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.46 
 
 		 485 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  44.48 
 
 		 496 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.29 
 
 		 485 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  44.84 
 
 		 477 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.9 
 
 		 493 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  37.36 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  36.63 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.66 
 
 		 484 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  43.25 
 
 		 492 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.06 
 
 		 484 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.64 
 
 		 479 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.37 
 
 		 485 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.63 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.28 
 
 		 465 aa  168  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.93 
 
 		 485 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  41.2 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.41 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.25 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.14 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  36.75 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  36.82 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  35.16 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  36.73 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  35.02 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  34.77 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  35.21 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  38.14 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.16 
 
 		 428 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.15 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  26.34 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  32.39 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  30.88 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  26.06 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  29.05 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  24 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  30.67 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  30.22 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  30.22 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  24.66 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  28.78 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  28.47 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  26.51 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  28.49 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  23.98 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  25.66 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  24.39 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  23.94 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  25.3 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  25.36 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  25.86 
 
 		 346 aa  45.8  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  27.96 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  24.83 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  24.09 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  20.73 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>