66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0125 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  75.3 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  45.23 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  44.76 
 
 		 260 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  36.48 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  37.76 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  34.68 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  32.92 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  31.45 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  36.21 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  34.84 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  32.65 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  30.89 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  35.66 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  31.71 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  36.07 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  29.84 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  32.14 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  29.96 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1156  hypothetical protein  30.92 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00259628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  32.37 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  33.88 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  36.48 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0819  hypothetical protein  26.19 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15340  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00498288  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  26.25 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  29.96 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  22.54 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  31.43 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.34 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.48 
 
 		 493 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.72 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  24.79 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  32.84 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  32.58 
 
 		 496 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.07 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  29.67 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.37 
 
 		 495 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  23.81 
 
 		 346 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  27.66 
 
 		 492 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.33 
 
 		 479 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.09 
 
 		 493 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.63 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  27.18 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.43 
 
 		 485 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.43 
 
 		 485 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.32 
 
 		 480 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  22.46 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  24.14 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.46 
 
 		 485 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.73 
 
 		 485 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  30.41 
 
 		 474 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  31.25 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.96 
 
 		 300 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  23.51 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.86 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.19 
 
 		 476 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>