68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0825 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  68.73 
 
 
283 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  43.02 
 
 
257 aa  202  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  41.63 
 
 
258 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  39.77 
 
 
252 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  35.8 
 
 
247 aa  185  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  38.87 
 
 
255 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  40.15 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  38.17 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  31.66 
 
 
247 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  32.44 
 
 
249 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  30.89 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  31.4 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  28.68 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  28.68 
 
 
243 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  29.69 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  29.57 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  31.01 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  28.29 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  29.34 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  26.25 
 
 
248 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15340  hypothetical protein  26.81 
 
 
258 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00498288  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  26.85 
 
 
232 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  27.06 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  26.59 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  25.86 
 
 
249 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1156  hypothetical protein  25.29 
 
 
243 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00259628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  23.57 
 
 
247 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  23.75 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0819  hypothetical protein  26.17 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  22.26 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  28.72 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  23.15 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  24.42 
 
 
477 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  27.89 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  24.12 
 
 
492 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  27.17 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  28.93 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
490 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.15 
 
 
493 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.46 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.63 
 
 
485 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  23.12 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.08 
 
 
484 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.53 
 
 
484 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.42 
 
 
465 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  27.27 
 
 
278 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  22.56 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.21 
 
 
491 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  21.74 
 
 
485 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  24.07 
 
 
496 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.49 
 
 
480 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  21.65 
 
 
485 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  27.93 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  27.12 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.93 
 
 
485 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  26.54 
 
 
474 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.98 
 
 
495 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  26.97 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  21.55 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.33 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.26 
 
 
476 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  21.31 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  19.42 
 
 
485 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>