67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1758 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.57 
 
 
495 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.74 
 
 
493 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  48.07 
 
 
496 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.72 
 
 
484 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.69 
 
 
484 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.83 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.26 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.91 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.91 
 
 
480 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.12 
 
 
476 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.33 
 
 
485 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.07 
 
 
493 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  47.19 
 
 
477 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.17 
 
 
479 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  37.17 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  41.7 
 
 
492 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  37.5 
 
 
265 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.37 
 
 
247 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.86 
 
 
279 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.03 
 
 
465 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.01 
 
 
476 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.49 
 
 
485 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  38.08 
 
 
474 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.77 
 
 
485 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.93 
 
 
490 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  38.26 
 
 
295 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
491 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  34.69 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  34.06 
 
 
279 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  33.7 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  33.71 
 
 
282 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  32.95 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.83 
 
 
546 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  32.64 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  35.25 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  30.34 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.37 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  33.57 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  25.57 
 
 
507 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  25.19 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  28.9 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  23.4 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  27.05 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  24.19 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  30.5 
 
 
245 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  28.78 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  23.53 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  27.34 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  32.58 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  32.84 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  26.14 
 
 
256 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  23.46 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  27.37 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  29.55 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  22.56 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  25.91 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  24.83 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  21.08 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  24.64 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  24.14 
 
 
232 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  23.02 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>