66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4057 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  538  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  46.8 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  45.63 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  46.99 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  44.84 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  40.15 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  35.91 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  35.57 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  35.6 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  30.71 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  31.66 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  30.16 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  31.6 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  33.59 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  31.45 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  31.35 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  29.96 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  32.43 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  31.78 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  30.36 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  29.8 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  30.08 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  27.42 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  25.35 
 
 		 302 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1156  hypothetical protein  25.6 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00259628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  27.49 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  26.69 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15340  hypothetical protein  23.44 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00498288  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  26.24 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0819  hypothetical protein  23.81 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  23.57 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  30.99 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  27.67 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  26.14 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.77 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  27.21 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.65 
 
 		 479 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  28.1 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.67 
 
 		 485 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.66 
 
 		 476 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  26.8 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.42 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  26.35 
 
 		 496 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  26.28 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.83 
 
 		 495 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.95 
 
 		 485 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.52 
 
 		 491 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  25.48 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.52 
 
 		 490 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.39 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  28.57 
 
 		 474 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  25.45 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  24.69 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.61 
 
 		 480 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.16 
 
 		 476 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  23.03 
 
 		 493 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  24.32 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  22.54 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.38 
 
 		 484 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  24.32 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  23.75 
 
 		 485 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.83 
 
 		 484 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.67 
 
 		 465 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>