65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01932 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  100 
 
 		 265 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  79.92 
 
 		 264 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.57 
 
 		 476 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.82 
 
 		 495 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.3 
 
 		 493 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.62 
 
 		 485 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.53 
 
 		 480 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.23 
 
 		 485 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 496 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.38 
 
 		 484 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  38.62 
 
 		 477 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41 
 
 		 484 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.32 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.38 
 
 		 485 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  40.98 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.4 
 
 		 493 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.14 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.73 
 
 		 479 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.62 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.15 
 
 		 485 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 		 485 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  36.18 
 
 		 474 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.47 
 
 		 465 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  33.73 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.09 
 
 		 490 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.71 
 
 		 491 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  30.8 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  33.21 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  32.54 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  29.2 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  27.96 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  27.24 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  27.82 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.11 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  26.26 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  28.19 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  22.17 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  27.4 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  23.78 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  24.32 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  23.12 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  23.4 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  26.76 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  23.78 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  27.08 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  26.45 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  26.43 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  22.17 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  23.93 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  24.83 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  24.77 
 
 		 428 aa  48.9  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  22.46 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  27.86 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  22.08 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  23.43 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  24.32 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  26.09 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  21.98 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  23.44 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  25.15 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  24.32 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>