96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1325 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  74.23 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  71.82 
 
 		 294 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.2 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  35.23 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.51 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.02 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.57 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  33.47 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  33.47 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  37.57 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  36.53 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  37.04 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.01 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  38.22 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  37.14 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  33.82 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.65 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  31.36 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.38 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.38 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  29.61 
 
 		 238 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  29.15 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.64 
 
 		 236 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  30 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.87 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  36 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.08 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  30.77 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  36 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  34.71 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  26.74 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  27.15 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  33.52 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.81 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  27.81 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.15 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  27.15 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  27.15 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  26.52 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  24.69 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  28.26 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.24 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  24.6 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  24.9 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  25.75 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  26 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  27.45 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.41 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  26.53 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  27.57 
 
 		 514 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  28.57 
 
 		 515 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  27.23 
 
 		 519 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  27.23 
 
 		 519 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  27.35 
 
 		 519 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  27.81 
 
 		 548 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0216  carboxyl transferase  25.77 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  29.29 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  27.71 
 
 		 522 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  27.31 
 
 		 520 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  26.95 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  29.17 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0796  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  25.22 
 
 		 518 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  27.27 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  28.99 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  24.81 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  26.42 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  26.19 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  25.27 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  28.17 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  24.36 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  27.4 
 
 		 529 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  26.8 
 
 		 529 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  23.48 
 
 		 514 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  27.08 
 
 		 515 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  27.74 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0176  carboxyl transferase  25.62 
 
 		 527 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  27.27 
 
 		 515 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  25.73 
 
 		 531 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  25.53 
 
 		 543 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  26.62 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  26.44 
 
 		 527 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  27.74 
 
 		 510 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  24.81 
 
 		 510 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  26.63 
 
 		 527 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  25.79 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  27.56 
 
 		 486 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  27.59 
 
 		 516 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  27.74 
 
 		 510 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>