58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5371 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  81.55 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  78.88 
 
 		 233 aa  370  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  78.54 
 
 		 233 aa  345  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  70.69 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  52.17 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  52.61 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  45.99 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  51.52 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.79 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  34.87 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  39.22 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  39.41 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.79 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.36 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  38.43 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  40.11 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.64 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.71 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  35.82 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.11 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  40.64 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  40.64 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  41.38 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  39.55 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.84 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.1 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  37.24 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  30.97 
 
 		 294 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  32.21 
 
 		 499 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  36 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  31.84 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.86 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.68 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.19 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  31.07 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.04 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  27.86 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  31.82 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  33.07 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  33.07 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  32.84 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  34.81 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.1 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  30.72 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  33.82 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  30.6 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.51 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.33 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.33 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  32.86 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.37 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>