115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2893 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  100 
 
 		 226 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  74.27 
 
 		 239 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  57.34 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  51.52 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  50.98 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  51.52 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  52.83 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  52.41 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  43.6 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  40.2 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  51.01 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  40 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.27 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.27 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  43.01 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  37.33 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  42.2 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.89 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  39.25 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  38.71 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  44.27 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  43.3 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.73 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  39.74 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  39.74 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  39.74 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.73 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.83 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  31.2 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  30.69 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  30.05 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  33.86 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.65 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  36.72 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  31.06 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  36.62 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  34.83 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  31.07 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.8 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.51 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  34.96 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  31.03 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  32.52 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.39 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  49.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.6 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  30.52 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  67.57 
 
 		 382 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  32.8 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.07 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  86.21 
 
 		 439 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.1 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  84.38 
 
 		 75 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  92.31 
 
 		 87 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  88.46 
 
 		 113 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  72.97 
 
 		 383 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  79.31 
 
 		 814 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  67.57 
 
 		 387 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  88.46 
 
 		 358 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  72.5 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  92 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3087  hypothetical protein  95.83 
 
 		 123 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.678329  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  88 
 
 		 382 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1973  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  91.67 
 
 		 1083 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  82.14 
 
 		 833 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  88.46 
 
 		 721 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  91.67 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  91.67 
 
 		 766 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  68.42 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  91.67 
 
 		 166 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  91.67 
 
 		 2200 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  53.85 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  88.46 
 
 		 93 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  91.67 
 
 		 100 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  91.67 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  91.67 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  88.46 
 
 		 108 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  88.46 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  91.67 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  88.46 
 
 		 82 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  91.67 
 
 		 93 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  84.62 
 
 		 634 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  67.5 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  78.12 
 
 		 94 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  91.67 
 
 		 100 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  91.67 
 
 		 106 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  88.46 
 
 		 95 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  88.46 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  91.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  91.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  91.67 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>