60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0791 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  74.27 
 
 		 226 aa  271  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  56.28 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  52.61 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  52.17 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  50.66 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  50.86 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  49.78 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  51.87 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  38.76 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  42.86 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  46.93 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  43.87 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.15 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.27 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.27 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  39.13 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  40.71 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.16 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  41.51 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  41.51 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  40.95 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  41.21 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  45.11 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  40.87 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.38 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  37.99 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  40.28 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  34.51 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  34.44 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  32.95 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  39.37 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  39.37 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.97 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  34.78 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.43 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  31.5 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  40.17 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.07 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.89 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  38.46 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  36.07 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  36.44 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  36.07 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  33.59 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.99 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.82 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.78 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.06 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.06 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0523  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, alpha subunit  26.92 
 
 		 299 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.90241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21690  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  33.09 
 
 		 440 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.324393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>