86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5384 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  100 
 
 		 108 aa  207  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  88.89 
 
 		 108 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  65.74 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  60.75 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  55.14 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  54.21 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  49.52 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  53.7 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  53.85 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  48.57 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  51.89 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  58.16 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  50.98 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  50 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  46.73 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  55.42 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  55.42 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  56.58 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  42.48 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  40.19 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  55.71 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  44.66 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  40.54 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  38.94 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  44.16 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  46.75 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  45.1 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  43.36 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6407  hypothetical protein  52.38 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00903722  normal  0.080212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5659  hypothetical protein  52.38 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.879701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5433  hypothetical protein  52.38 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31412  normal  0.0551629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  39.81 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  39.81 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  39.81 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  41.44 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  39.09 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  43.53 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  43.12 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  41.59 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  40.78 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  37.86 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  38.1 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  38.18 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  39.82 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  40.95 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  35.24 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  37.86 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  37.37 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  39.81 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  38.83 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  34.82 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  37.86 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  34.52 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  33.93 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  34.95 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  33.98 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  30.91 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  34.95 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  35.92 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  34.95 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  34.31 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  33.72 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  39.42 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  33.72 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  37.29 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2028  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305107  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  30.1 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  32.04 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  30.56 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>