22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2028 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2900  hypothetical protein  38.31 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0439527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3858  hypothetical protein  41.9 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  35.14 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  38.16 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  34.65 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  34.58 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  34.65 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  30.09 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  35.85 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  33.01 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  40.98 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  29.36 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  36.89 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  28.3 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  32.08 
 
 		 136 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  32.04 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  44 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  30.1 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>