68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1443 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  261  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  82.09 
 
 		 134 aa  220  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  72.39 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  76.87 
 
 		 135 aa  194  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  67.91 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  64.84 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  67.97 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  63.85 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  63.85 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  63.85 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  63.57 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  63.43 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  56.15 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  55.3 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  54.2 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  53.49 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  62.99 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  62.99 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  62.99 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  49.22 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  48.44 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  45.86 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  45.45 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  44.55 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  44.25 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  40 
 
 		 118 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  37.4 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  45.13 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  39.47 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  41.59 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  42.48 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  40.91 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  43.24 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  39.82 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  39.32 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  45.65 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  37.84 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  41.44 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  41.44 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  36.94 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  43.01 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  41.94 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  42.31 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  40 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  39.13 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  36.46 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  39.82 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  45.68 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  45.33 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  35.59 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  35.23 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  35.23 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  32.76 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  27.68 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  27.68 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2028  hypothetical protein  28.3 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305107  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  29.35 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  29.35 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  31.53 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  31.25 
 
 		 110 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>