85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2742 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  204  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  63.55 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  62.26 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  59.43 
 
 		 109 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  55.24 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  57.8 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  54.29 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  58.65 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  51.85 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  56.31 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  57.14 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  53.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  49.02 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  53.77 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1029  protein of unknown function DUF326  62.5 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  50.48 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  53.77 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  58.43 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  58.43 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  55.66 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  56.1 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  50.53 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  47.52 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  56.1 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6028  hypothetical protein  57.33 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  47.73 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6438  hypothetical protein  57.97 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05446  hypothetical protein  41.35 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5433  hypothetical protein  59.68 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31412  normal  0.0551629 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5659  hypothetical protein  59.68 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.879701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1443  hypothetical protein  43.24 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6407  hypothetical protein  59.68 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00903722  normal  0.080212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4500  hypothetical protein  39.81 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2651  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2681  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0629818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2696  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  0.0518511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2272  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0443527  hitchhiker  0.00288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  40.74 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3312  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1568  protein of unknown function DUF326  45.79 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.979301  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18430  protein of unknown function (DUF326)  41.51 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1359  protein of unknown function DUF326  39.47 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3553  protein of unknown function DUF326  48.51 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1012  hypothetical protein  39.81 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1731  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  40.48 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  40.48 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  38.68 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2566  hypothetical protein  38.74 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  38.74 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1387  protein of unknown function DUF326  42.2 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  38.74 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3873  protein of unknown function DUF326  37.96 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  35.78 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3961  protein of unknown function DUF326  36.61 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000404111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  34.86 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  37.17 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  37.61 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  38.74 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3469  hypothetical protein  33.94 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.484511  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  37.17 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  36.7 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  37.62 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0358  protein of unknown function DUF326  35.45 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2019  protein of unknown function DUF326  40.19 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  38.53 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  33.96 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4463  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4294  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4194  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0756  hypothetical protein  34.52 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4281  hypothetical protein  44.23 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  35.64 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  33.65 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  32.67 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3037  putative cytoplasmic protein  38.54 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>