56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1745 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1745  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.820636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0074  hypothetical protein  67.29 
 
 
139 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2301  hypothetical protein  60.38 
 
 
111 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.011001  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0107  hypothetical protein  60.19 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.893483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2537  protein of unknown function DUF326  57.41 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.282403  normal  0.124712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1100  protein of unknown function DUF326  56.48 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9857  hypothetical protein  56.64 
 
 
112 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0742  hypothetical protein  54.72 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.409745  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4339  hypothetical protein  55.66 
 
 
108 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5873  protein of unknown function DUF326  56.31 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7164  hypothetical protein  55.77 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.660581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0998  hypothetical protein  52.78 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.655611  normal  0.0600381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2812  hypothetical protein  55.14 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140577  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0944  protein of unknown function DUF326  38.94 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0417404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2338  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0947  protein of unknown function DUF326  38.94 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6859  protein of unknown function DUF326  42.59 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1871  hypothetical protein  40.38 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1744  protein of unknown function DUF326  41.51 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357012  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2616  hypothetical protein  37.74 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.861832  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2742  hypothetical protein  39.62 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0635119  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1715  protein of unknown function DUF326  40.19 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.188402  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6810  protein of unknown function DUF326  39.81 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6286  hypothetical protein  40.57 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.377613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4392  hypothetical protein  38.32 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.920187  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0182  protein of unknown function DUF326  37.62 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00410  hypothetical protein  36.19 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5384  protein of unknown function DUF326  35.24 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1843  protein of unknown function DUF326  36.19 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741665  hitchhiker  0.000000138037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1351  ferredoxin  37.07 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000258555  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4937  protein of unknown function DUF326  34.62 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0193  hypothetical protein  35.19 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.506312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0272  ferredoxin  35.19 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1976  hypothetical protein  34.55 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118246  normal  0.0106362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0903  hypothetical protein  39.81 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2321  hypothetical protein  32.1 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2991  hypothetical protein  30.84 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.213565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2464  hypothetical protein  33.65 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.26727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0783  protein of unknown function DUF326  44.44 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439837  normal  0.172505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2358  hypothetical protein  34.55 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28152  hitchhiker  0.000380376 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5753  hypothetical protein  41.43 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.947142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1513  protein of unknown function DUF326  33.62 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0756621  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5519  putative cytoplasmic protein  41.43 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1970  hypothetical protein  33.03 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3045  hypothetical protein  33.02 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1573  ferredoxin  33.02 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2415  hypothetical protein  34.02 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2988  hypothetical protein  34.02 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355146  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33020  hypothetical protein  32 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4267  protein of unknown function DUF326  29.73 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.508496  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3730  protein of unknown function DUF326  31.46 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6407  hypothetical protein  33.8 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00903722  normal  0.080212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4807  protein of unknown function DUF326  31.46 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756182  normal  0.631521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5659  hypothetical protein  33.8 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.879701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0085  hypothetical protein  34.23 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22530  protein of unknown function (DUF326)  32.14 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>